أدانت هيئة علماء اليمن بأشد العبارات التفجيرات "الإرهابية" التي استهدفت المملكة العربية السعودية، مؤكدة أن هذا الحادث الآثم الذي استهدف جوار مسجد رسول الله صلى الله عليه وسلم يعد طعنة غائرة أدمت قلوب جميع المسلمين في العالم. كما أدانت – في بيان لها مساء الثلاثاء- "التفجير الإرهابي في جدة، والتفجيرين الإرهابيين اللذين استهدفا مسجدا في مدينة القطيف السعودية"، مشدّدة على أن "هذه الجرائم النكراء والفكر الضال لا تمت لديننا الإسلامي بأي صلة".
وتقدمت الهيئة بخالص العزاء لخادم الحرمين الشريفين الملك سلمان بن عبد العزيز، ولحكومة وشعب المملكة العربية السعودية، ولعائلات جنود الأمن الذين "تصدوا للإرهابي الذي كان يعتزم تفجير مسجد رسول الله صلى الله عليه وسلم، وتسأل الله تعالى أن يتغمدهم بواسع رحمته ويتقبلهم في الشهداء، وأن يمن على الجنود المصابين بالشفاء العاجل".