أكد الداعية الاسلامي يوسف القرضاوي، الذي يعد من أهم مرجعيات تيار الاخوان المسلمين، أن إعلان تنظيم الدولة الاسلامية الذي سيطر على مناطق واسعة من العراقوسوريا إقامة الخلافة، هو باطل شرعا ولا يخدم المشروع الاسلامي." وقال بيان للاتحاد العالمي للعلماء المسلمين الذي يرأسه القرضاوي في بيان يحمل توقيع الأخير إن الخلافة نتمنى أن تقوم اليوم قبل غد، لكن الخطوة التي اتخذها تنظيم الدولة الاسلامية يترتب عليه آثار خطيرة على أهل السنة في العراق والثورة في سوريا.
واعتبر الاتحاد أن إعلان الخلافة وتعيين أبو بكر البغدادي خليفة للمسلمين لا يلبي عدة شروط شرعية، لاسيما مبدأ كون الخليفة نائبا عن الأمة الإسلامية بأسرها، ومبدأ الشورى، فضلا عن ربط الخلافة بتنظيم بعينه اشتهر بين الناس بالتشدد، ما يؤدي الى الحاق ضرر بمشروع الخلافة.