قال زعيم تنظيم القاعدة أيمن الظواهري متوجهاً الى زعيم جبهة النصرة ابو محمد الجولاني إن الامر له "وكلِ جنود جبهة النصرة الكرام، والمناشدة لكل طوائف وتجمعات المجاهدين في شام الرباط، بأن يتوقفوا فورًا عن أي قتال فيه عدوان على أنفس وحرمات إخوانهم المجاهدين وسائر المسلمين، وأن يتفرغوا لقتال اعداء الاسلام من البعثيين والنصيريين وحلفائهم من الروافض". وتجري معارك عنيفة بين تنظيم دولة الاسلام في العراق والشام (داعش) منذ مطلع كانون الثاني/يناير مع تشكيلات أخرى من المعارضة السورية المسلحة على رأسها "جبهة النصرة"، الفرع السوري لتنظيم القاعدة.
واندلعت هذه المواجهات التي قتل فيها نحو اربعة آلاف شخص بعد اتهامات واسعة وجهت الى تنظيم "الدولة الاسلامية" الذي تأسس في العراق بأنه "من صنع النظام" السوري ويقوم ب"تنفيذ مآربه". وتأخذ الكتائب المقاتلة ايضًا على تنظيم الدولة الاسلامية تطرفه في تطبيق الشريعة الاسلامية واصداره فتاوى التكفير عشوائيًا وقيامه بعمليات خطف واعدام طالت العديد من المقاتلين. وفي شباط/فبراير، اعلنت القيادة العامة لتنظيم القاعدة تبرؤها من "الدولة الاسلامية" ودعتها الى الانسحاب من سوريا. وفي التسجيل الجديد يدعو الظواهري ايضاً زعيم "الدولة الاسلامية في العراق والشام" ابو بكر البغدادي الى التفرغ "للعراق الجريح الذي يحتاج إضعاف جهودكم" قائلاً "تفرغوا له حتى وإن رأيتم أنفسكم مظلومين أو منتقصاً من حقكم لتوقفوا هذه المجزرة الدامية، وتتفرغوا لأعداء الإسلام والسنة في عراق الجهاد والرباط".