بعث فخامة الأخ الرئيس علي عبدالله صالح - رئيس الجمهورية - برقية عزاء ومواساة إلى الأخ محمد عبدالقادر أحمد السقاف وإخوانه وكافة أفراد أسرته في وفاة العلامة الكبير الشيخ عبدالقادر بن أحمد السقاف.. جاء فيها : تلقينا ببالغ الحزن والأسى وفاة العلامة الكبير الشيخ عبدالقادر بن أحمد السقاف الذي انتقل الى جوار ربه بعد حياة حافلة بالعطاء والبذل في سبيل خدمة الدين والوطن . فلقد كان رحمه الله عالما زاهدا ومجتهدا ومربيا فاضلا، تتلمذ على يديه أجيال عديدة من داخل الوطن وخارجه وساهم في نشر فكره وفكر من سبقوه من علمائنا الأفاضل في حضرموت وغيرها . كما كان - رحمه الله - مثالاً للتفاني والإخلاص والتواضع والتقوى والورع، ونسأل الله العلي القدير أن يتغمده بواسع رحمته ويسكنه فسيح جناته وأن يلهمكم أهله وذويه وتلامذته الصبر والسلوان . « إنا لله وإنا إليه راجعون ».