رفضت وزارة الداخلية اليمنية قبول أي عذر من تنظيم القاعده ، صرح بذالك المتحدث الرسمي بوزارة الداخلية العميد محمد القاعدي : " لا يمكن أن تقبل منهم الدولة أي عروض ". وقال ل«الشرق الأوسط»: أن جرائم التنظيم لا تنحصر في الهجوم الذي استهدف المستشفى وحسب، بل طالت عملياتهم المواطنين. وكان قد اعتذر تنظيم جزيرة العرب عن مجزرة مستشفى وزارة الدفاع في العاصمة صنعاء التي راح ضحيتها 56 بريئا، بذريعة أن المهاجمين قصدوا الهجوم على غرفة تحكم بوزارة الدفاع، وليس المستشفى. وقال قاسم الريمي القائد العسكري لتنظيم القاعدة إن التنظيم مستعد لدفع الدية وتحمل تعويضات العلاج، وأضاف الريمي الشهير ب«أبي هريرة الصنعاني» في أول ظهور بعد اعتقاد مقتله سنة 2010 أن الخطأ " يتحمله أحد عناصر التنظيم، لم يلتزم بالتعليمات".