خلافا لمواقف الإخوان المسلمين التي تصدر من مركزهم الرئيسي في القاهرة أو من فرعهم المؤثر في اليمن "الاصلاح المعارض" أو حتى ذراعهم العسكرية القوية «حماس» اوبقية الفروع بالمنطقة، من التمرد الحوثي في صعده المدعوم ايرانيا ومطالبهما الأولى للسعودية بعدم استهداف الحوثيين بعد تسللهم أراضيها وقتل جنودها ،والثانية برفضها لحرب الحكومة اليمنية عليهم، نددت جماعة الإخوان المسلمين في سورية بما أعدته المخطط الحوثي "الاثيم" في اليمن والسعودية، معتبرةً أنه "يندرج ضمن مخطط مرسوم بهدف المزيد من تقسيم بلاد العرب والمسلمين". الجماعة، وفي بيان وردت نسخة منه إلى وكالة "فرانس برس"، أوضحت أن "من يتابع ما يجري من العراق إلى الشام إلى لبنان إلى اليمن، يدرك بوضوح أن ما يجري على أرض اليمن ليس حلقة في الخلاء، بل هو جزء من مخطط مرسوم غايته دق المسامير الديمغرافية والسياسية في بنية المجتمعات العربية والإسلامية بغية تمزيقها وإثارة القلاقل فيها والتحكم بإنسانها وقرارها". وأضاف بيان جماعة "الإخوان المسلمين" في سوريا: "حين تزحف فلول مجموعات الحوثي في هذه الأيام إلى أراضي المملكة العربية السعودية، إنما تكشف عن النيات المبيتة للقائمين على هذا المشروع الأثيم، الذي هو في حقيقته ليس مشروع دفاع عن وجود أو مطالبة بحقوق، بل هو مشروع بناء لكيان مزروع ليؤدي دوراً استراتيجياً في زيادة حجم الفرقة والانقسام في قلب بلاد العرب والمسلمين".