سجل الجهاز المركزي للرقابة والمحاسبة العديد من المخالفات في حسابات البرنامج الاستثماري لمحافظة المهرة للعام المالي 2006م.. بإجمالي (269.186.369) ريالاً، منها عدم تنفيذ (12) مشروعاً مدرجة ضمن البرنامج الاستثماري لعام 2006م والبالغ تكلفتها (83.237.000) ريال. وكشف تقرير جهاز الرقابة والمحاسبة -حصلت "الجمهور" على نسخة منه - عن تنفيذ 4 مشاريع بتكلفة بلغت (8.970.000) ريال بالتكليف المباشر والممارسة دون مراعاة القيام بتنفيذها وفقا لإجراءات التقاعد المنصوص عليها في قانون المناقصات والمزايدات والمخازن الحكومية.. بالإضافة إلى صرف العديد من المبالغ سنويا ابتداءً من عام 2003م تحت مسمى نفقات مشروع بناء استراحة المحافظة، والذي تم الاستلام النهائي له خلال عام 2002م، وذلك لصالح صندوق النظافة والمقاول المنفذ بحجة تمويل المشروع من قبلهم بموجب توجيهات محافظ المحافظة دون الوقوف على الوثائق المستندية المحددة لمقدار المبالغ التي تم تمويل المشروع بها، ومصادر ذلك التمويل، بلغ إجمالي المبالغ المنصرفة على هذا النحو خلال الأعوام من 2003-2006م مبلغ (20.880.269) ريالاً.. كما تبين "بحسب التقرير" صرف مبلغ (37.422.135) ريالاً بالزيادة عن المستحق لمؤسسة علوبة للمقاولات مقابل الأعمال المنفذة في مشروع طريق هنقشيت – عشبون- والبالغة (32.577.820) ريالاً. وأشار التقرير إلى قيام الوحدة الحسابية في المحافظة بصرف مبلغ (9.871.672) ريالاً مقابل أعمال إضافية لعدد 6 مشاريع بدون وجه حق.. بالإضافة إلى صرف مبلغ 2 مليون ريال بدون وجه حق خصماً من اعتمادات المشاريع الرأسمالية والاسثتمارية لمديرية الغيظة تحت مسمى أتعاب القاضي المشارك في الحل لقضية مشروع (هنقشيت- عشبون). ومن المخالفات التي سجلها الجهاز المركزي للرقابة والمحاسبة في حسابات البرنامج الاستثماري لمحافظة المهرة لعام 2006م.. عدم التزام المقاولين المنفذين بالمدة المحددة في العقود وتسليم العمل منجزاً خلالها وفقا لأحكام المادة رقم (95/1) من اللائحة التنفيذية للقانون سالف الذكر، الأمر الذي ترتب عليه حرمان خزينة الدولة من مبلغ (106.805.287) ريالاً كغرامات تأخير عن تنفيذ العديد من المشاريع.